据商务部网站音讯，根据《中华人民共和国货品进出口处理条例》《化肥进口关税配额处理暂行办法》，商务部拟定了《2025年化肥进口关税配额总量、分配原则及相关程序》。概况如下：
2025年化肥进口关税配额总量为1365万吨。其间，尿素330万吨；磷酸氢二铵690万吨；复合肥345万吨。
2025年化肥公营交易关税配额数量分别为：尿素297万吨，磷酸氢二铵352万吨，复合肥176万吨。公营交易企业中国中化集团公司、中国农业出产资料集团公司在公营交易总量内请求关税配额。
2025年化肥非公营交易配额数量分别为：尿素33万吨，磷酸氢二铵338万吨，复合肥169万吨。非公营交易企业在非公营交易总量内请求关税配额。
2025年化肥进口关税配额施行先来先领的分配的办法。凡在工商行政处理部门挂号注册的企业，在其经营范围内均可请求化肥进口关税配额。
企业申领化肥进口关税配额施行先来先领，直至化肥进口关税配额总量申领结束。企业申领化肥进口关税配额时，其可申领的开始关税配额数量根据以往实践关税配额运用状况设定，在开始关税配额数量内企业可分次申领《化肥进口关税配额证明》。企业报关进口后或将未运用的化肥进口关税配额退回后，可在不超越开始关税配额数量的范围内再次申领化肥进口关税配额。
2025年开始数量以2024年开始数量为根底，并按2024年核销率进行调整：
（五）2024年之前有成绩，但2024年没有申领化肥进口关税配额证明的企业，开始量保持不变；
（七） 2025年关税配额开始申领量最高不超越50万吨，最低不低于2000吨。
自2022年9月29日起，全国范围试点施行《化肥进口关税配额证明》电子数据与报关单电子数据的联网核对。企业向受商务部托付的化肥进口关税配额发证组织（以下简称关税配额发证组织）申领化肥进口关税配额，需供给以下资料：
（六）2025年度内初次申领的新请求企业除供给上述规则资料外，需一起供给经营执照及企业代码，中外合资经营企业、中外合作经营企业和外资企业需供给同意证书或根据《外商投资企业建立及改变存案处理暂行办法》获得的存案回执。
各关税配额发证组织担任受理所在地企业化肥进口关税配额请求，并在5个作业日内为请求资料完全、符合条件的企业签发《化肥进口关税配额证明》。
初次申领化肥进口关税配额的企业，可经过各关税配额发证组织以邮递、快递、现场提交的方法向商务部行政事务服务大厅提交请求和上述第六条第六款所要求资料。经商务部审阅存案后，企业即可向关税配额发证组织申领化肥进口关税配额证明。
《化肥进口关税配额证明》有效期3个月，最迟不允许超出2025年12月31日。延期或许改变的，需从头处理，旧证吊销一起换发新证，并在备注栏中注明原证号。
企业在报关进口的10个作业日内，经过商务部事务体系一致渠道向关税配额发证组织提交预核销已运用《化肥进口关税配额证明》的请求。预核销的已运用关税配额不计入企业可申领的开始关税配额数量，企业可按预核销数量再次申领《化肥进口关税配额证明》。企业处理悉数付汇、清关手续后，需经过商务部事务体系一致渠道向关税配额发证组织提交正式核销已运用《化肥进口关税配额证明》的请求。正式核销手续应在清关后3个月内完结。
关于确需延期付汇的企业，需由企业出函阐明状况，并许诺在付汇后，持银行出具的境外汇款请求书（企业联）到关税配额发证组织正式核销。
企业需将未运用或未悉数运用的《化肥进口关税配额证明》在有效期满后15个作业日内向关税配额发证组织提出退回请求。企业退回的未运用化肥进口关税配额数量归入全国未运用化肥进口关税配额总量。
商务部配额许可证事务局担任全国《化肥进口关税配额证明》核销作业的监督和处理，并将分季度监测、发布企业《化肥进口关税配额证明》的核销率，即企业已核销数量（含预核销数量）/企业已申领总量。
商务部配额许可证事务局催促关税配额发证组织提示榜首季度末累计核销率低于25%的企业及时交回未用关税配额，对第二季度末累计核销率低于25%的企业给予警示和正告，对第三季度末累计核销率低于25%的企业，采纳扣减50%开始关税配额数量、暂停发放新的《化肥进口关税配额证明》等办法。
化肥进口关税配额剩下量缺乏年度配额总量20%时，商务部配额许可证事务局将每半个月发布一次全国化肥进口关税配额剩下数量。
请求企业应恪守国家安全出产等有关法令和法规，对其报送资料的真实性担任，并一起出具加盖企业公章的许诺函。企业如有假造、变造报送资料的行为，将追究其法令责任。
对有上述违反法令规则的行为的企业，关税配额处理组织3年内不受理其《化肥进口关税配额证明》请求。
自2024年12月15日起，关税配额处理组织受理化肥进口关税配额请求并发放2025年《化肥进口关税配额证明》。
